De la col·laboració entre la ciència i la indústria ha sorgit un mètode innovador per combatre les malalties dels cultius mitjançant bacteris locals beneficiosos del sòl.
Un equip de científics del John Innes Center (Regne Unit) va aïllar i va provar centenars de soques de bacteris Pseudomonas del sòl recollit de les granges i després va seqüenciar els genomes de 69 d'ells.
En comparar els genomes de soques que inhibeixen l'activitat dels patògens amb els que no ho fan, l'equip va poder identificar un mecanisme clau per protegir els cultius de patata dels bacteris nocius.
Després, utilitzant una combinació de química i genètica i una sèrie d'experiments, els científics van demostrar que la producció de petites molècules anomenades lipopèptids cíclics és important per controlar la crosta de la patata (una malaltia bacteriana que causa danys importants al cultiu de la patata). Aquestes petites molècules tenen un efecte antibacterià sobre els bacteris patògens que causen la crosta i ajuden els bacteris beneficiosos Pseudomonas a migrar i colonitzar les arrels de les plantes.
Els experiments també han demostrat que el reg provoca canvis significatius en la població genèticament diversa de Pseudomonas al sòl.
L'estudi, publicat a eLife, ofereix un mètode pel qual els científics poden estudiar el microbioma de pràcticament qualsevol àrea d'un camp i tenir en compte diferents condicions del sòl, agroquímics i ambientals.
Utilitzant els avenços en la seqüenciació genètica d'alta velocitat, els científics poden provar el microbioma del sòl per a bacteris beneficiosos i determinar quines molècules es produeixen per suprimir els patògens. El següent pas és propagar i retornar els microorganismes beneficiosos al mateix camp.
Les aplicacions potencials dels potenciadors del microbioma inclouen l'aplicació de còctels bacterians a la superfície dels tubercles com a esprai o directament al sòl mitjançant reg per degoteig.